Не знаю, что подразумевается под нормальной работой со слоями.
Слои сами по себе есть, настройки под них разные имеются. Прозрачность и прочие плюшки. Пользуюсь этим постоянно. Да вообще без слоев никуда в таких делах.
Может, где-то на уровне профи фотошоп и лучше. Но я до такого пока не задротил. Нет причин.